我和朋友合伙开公司，私下签订协议，他占股55%我占股45%，合法吗？

这个做法在法律上称为“股权代持”。你的45%股权由他代持。没有特别的情况，这样做并不违法。但是股权代持存在很多风险，主要承担风险的人是你。比如他负债了，别人冻结他名下的股权，或者他擅自抵押或转让股权，或者他涉及离婚、死亡等情况，导致股权被分割和继承，等等，仅凭一张股权代持协议，你的利益很容易受损，要主张你的股东权利也比较困难。另外，他100%的持有公司股份，对外属于一人公司。一人公司如果对外负债，很容易导致一人股东承担连带责任。

不合法。法律上，股权以登记为准。你将面临两个风险，第一，公司发展壮大了，资产增加了，你将得不到公司的增值对应的资产，第二，如果公司赔了，因为现在是认缴制，你将需要用个人资产补足未缴纳的出资款并承担有限责任。第三，你将没有合法的途径获得对公司的相应权利，如监管权和同意权以及否决权等。