对方公司欠我公司工程款三年以上，要怎么合法追回工程款？

诉讼时效为三年，建议到有管辖权的法院起诉，先中断时效。

一般的总包单位，即便没钱，只要不是歇业，还在经营，应该会有资金账目的进出。即便将来判决了不还款，还可以申请法院强制执行。

11万不是大数，应该有希望拿回钱来。

首先协商，若协商不成则通过合同约定的争议解决方式，如人民法院起诉或仲裁委员会申请仲裁等程序解决。

先看下合同付款节点。如果是工程全部完成，并且验收合格后。就可以按照合同进行法律申请。说白了就是看是你单位没有干完或者质量不好，甲方拖着不给？还是已经干完了，甲方故意拖着不给。